在保税区降低转口贸易成本可从多方面着手。首先是政策利用，深入研究保税区的税收优惠政策，比如利用保税区的保税仓储政策，货物在保税区内存储可不缴纳进口关税，减少资金占用成本。

物流优化也很关键，与可靠的物流供应商合作，整合运输资源，选择最佳运输路线。例如，根据货物目的地和运输时间要求，合理搭配海运、陆运方式，降低运输费用。

仓储管理方面，优化库存管理，实时监控货物库存，减少库存积压，降低仓储费用。同时，提高仓库空间利用率，避免资源浪费。

可以争取与保税区内的其他企业合作，进行拼箱运输，这样能分摊运输成本，降低单位货物的运费。

在仓储环节，采用先进的仓储管理系统，提高仓储作业效率，减少人工成本和货物损耗。

与供应商协商更有利的采购条款，比如延长付款期限，这样可优化资金流，间接降低成本。

关注汇率波动，通过远期外汇合约等金融工具锁定汇率，避免因汇率变动造成损失，从而降低成本。

利用保税区的加工增值服务，对货物进行简单加工，提升产品附加值，在不增加过多成本的情况下提高利润。

定期评估物流和仓储合作伙伴，通过重新招标等方式，确保能获得更有竞争力的价格。

建立高效的信息管理系统，及时获取市场动态，以便更精准地决策，减少不必要的成本支出。

优化报关流程，熟悉保税区报关规则，避免因报关失误导致的延误和额外费用。