出口代理公司常见收费方式主要有两种。一种是按订单金额的一定比例收费，比例通常在1%-5%左右，具体会因货物类型、贸易复杂程度等因素有所不同。比如，普通日用品出口代理，比例可能在1%-2%；如果是涉及特殊认证、复杂贸易条款的产品，比例可能达到3%-5%。

另一种是按单收取固定费用，一般在几百元到数千元不等，这种方式常用于流程相对简单、金额较小的订单。此外，可能还会有一些额外费用，如报关费、文件费、物流操作费等。报关费大概200 - 500元/票；文件费几十元到一两百元；物流操作费根据实际操作情况而定。选择代理公司时，要详细了解其收费明细，避免后期产生纠纷。

有些出口代理公司除了基本代理费，还会收取一些杂费，像产地证办理费，一般一份在100 - 200元左右。如果货物需要做商检，也会有商检费用，这个根据货物的具体情况收费，几百元不等。

收费还可能和出口目的地有关，要是运往一些偏远或政策复杂的地区，代理公司可能会适当提高收费标准，因为操作难度和风险相对较大。

部分代理公司会根据服务内容的多少来收费。比如只负责报关，费用可能相对低些；要是包含订舱、物流跟踪等全方位服务，收费肯定会高一些。

有时候出口代理公司会根据市场行情调整收费。如果近期业务量多，竞争激烈，可能收费会稍低；要是业务量少，费用或许会有所上升。

货物的重量和体积也可能影响收费。像一些体积大但重量轻的泡货，或者超重货物，在运输和操作上可能更麻烦，代理公司可能会多收点费用。

如果涉及到外汇结算，有的代理公司可能会收取外汇结算手续费，一般按结算金额的一定比例收取，比例通常不高。

长期合作的客户，代理公司可能会给予一定的优惠。比如在代理费上适当降低比例，或者减免一些杂费。

一些代理公司对于紧急订单会额外收费，毕竟需要加急处理各种流程，人力物力成本增加了。

有些代理公司会有最低收费标准。即使订单金额小，按比例算的代理费很少，也会按最低标准收取，防止过低的订单影响收益。