进出口代理公司常见的收费方式主要有以下几种：

一是按货值的一定比例收费，这是较为普遍的。比例通常在1%-5%左右，具体取决于货物类型、贸易复杂程度等。比如普通日用品，代理比例可能较低；而一些高价值、监管要求严格的产品，比例会高些。

二是按票计费，一票可能收取几百元到数千元不等，适合货值低但批次多的业务。

三是收取固定服务费，双方根据业务量协商一个固定金额。

一般正规的代理公司如中贸达，收费项目会明确列出，不会有隐藏费用。但要注意合同条款，明确服务范围与收费明细，避免后期纠纷。

有些进出口代理公司会针对不同服务环节收费，像报关、报检、运输安排等，每个环节分别计费，你得问清楚各项收费标准。

还有可能涉及到一些杂费，比如文件处理费、码头操作费等，虽然单笔费用不高，但累计起来也不是小数目，签合同前要问明白。

如果货物需要特殊处理，比如冷链运输、熏蒸消毒，代理公司会额外收取相应费用，这部分费用也得提前了解。

有的代理公司会依据市场行情调整收费，比如汇率波动大或者行业竞争变化时，收费可能会有变动，签合同最好约定好价格稳定性。

服务区域不同收费也有差异，像一些偏远地区，运输成本高，代理收费可能会适当增加。

若是长期合作，代理公司或许会给一定优惠，你可以跟他们谈谈，争取更有利的收费条件。

对于紧急出货的订单，代理公司可能收取加急费，所以尽量合理安排出货时间，避免产生额外费用。

有些代理公司会因客户对文件处理速度、清关时效等特殊要求，收取额外费用，这些都要提前在合同里明确。