代理出口海运费的支付主体通常取决于双方事先签订的代理出口协议。如果协议中明确规定海运费由委托方(也就是您的公司)承担,那就需要您这边支付。若协议未作明确约定,一般来说,代理方主要职责是协助办理出口报关、报检、收汇核销等一系列出口手续,海运费不属于代理服务的常规范畴,所以大概率还是由委托方支付。
不过,实际业务中也存在代理方为了争取业务,承诺包含海运费在代理服务总价内的情况。如果您觉得代理方收费过高,可与代理方协商,重新界定费用承担范围。总之,关键在于协议约定,若没有约定,倾向委托方承担,但具体可协商解决。