外贸代理公司出口交税情况较为复杂。首先在增值税方面，如果代理出口的货物属于增值税应税范围，一般是由委托方办理出口退税，外贸代理公司无需缴纳增值税销项税额。若委托方是小规模纳税人，外贸代理公司可按规定代其办理出口免税申报。

关税方面，报关时，外贸代理公司需根据货物的归类确定适用的关税税率，向海关缴纳关税。其税率依据不同商品有所差异。

对于收汇环节，本身不涉及特定税种，但需准确申报外汇收入，确保符合外汇管理规定。另外，部分符合条件的出口货物可享受出口退税政策，外贸代理公司要协助委托方准备相关资料申请退税，以降低出口成本。

外贸代理公司若收取代理费，这部分需按服务业缴纳增值税，一般税率为6% 。但具体还得看公司是一般纳税人还是小规模纳税人，小规模纳税人征收率为3% 。

在印花税方面，外贸代理公司签订的出口代理合同需按合同金额的一定比例缴纳印花税，通常是万分之三。这在合同签订环节就需留意。

出口环节要是涉及消费税应税商品，外贸代理公司要注意，由委托方自行缴纳消费税，外贸代理公司仅负责按规定协助办理相关手续。

若外贸代理公司在出口业务中有涉及运输服务费用，取得合规发票可按规定抵扣进项税额，减少增值税税负。

对于一些特殊区域出口货物，如保税区等，税收政策可能有不同，外贸代理公司需熟悉相关特殊区域政策规定。

在城市维护建设税、教育费附加等附加税费上，若有实际缴纳的增值税，需按增值税税额的一定比例缴纳，一般市区城市维护建设税税率7% ，教育费附加3% 。

外贸代理公司还要关注出口退税率调整，及时调整业务策略，确保能充分享受税收优惠，避免因政策变动影响利润。

当外贸代理公司代收代付一些费用时，只要处理合规，通常不额外产生新的税务负担，但财务处理要清晰准确。