代理外贸出口常见的收费方式主要有以下几种。首先是按订单金额的一定比例收取代理费，这是较为普遍的方式。比例通常在1%-5%不等，具体取决于产品类别、贸易复杂度等。比如一些常规产品且操作简单的订单，代理费可能在1%-2%；而复杂的高科技产品，可能会达到3%-5%。

其次，有的代理会收取固定费用，比如每单收取2000 - 5000元，这种一般适用于订单金额较小但操作环节多的业务。

另外，还有一些代理会根据服务项目单独收费，像报关费、单证费等，报关费每单可能在300 - 800元，单证费每份100 - 300元。选择代理时，要详细了解其收费模式及包含的服务内容，避免后期出现额外费用。

有些代理除了基本代理费，还会收一些杂费，像物流辅助费，可能按每次几百元收，用于协助处理物流相关事务。

有按笔收费的，不管订单金额大小，一笔业务收个固定数，比如1500元，适合金额不高但业务频繁的情况。

还有的代理会根据出口货物的重量或体积收费，比如每吨或每立方米收取一定费用，不过这种方式相对少见。

代理费比例有时会和代理预计承担的风险挂钩，风险高比例就高些，像涉及一些新兴市场的订单。

一些代理会对退税部分收取一定比例费用，通常在退税金额的3%-8%，因为他们协助办理退税流程。

若需要代理垫资，还会收取垫资利息，一般根据市场利率及垫资金额、时间计算。

有的代理会根据客户的业务量给予一定折扣，业务量大代理费比例可能会降低。

还有港杂费，比如在港口产生的装卸、仓储等费用，会按实际发生额收取。

如果涉及到特殊认证或检验，代理也会收取相应的服务费用。