出口代理公司通常要办理一系列手续。首先是公司注册，包括确定公司名称、经营范围（涵盖进出口代理等相关业务），完成工商登记、税务登记等常规注册流程。

其次，需办理对外贸易经营者备案登记，这是企业合法从事对外贸易经营活动的前提，要提交相关资料到当地商务主管部门办理。

再者，要进行海关备案，以便货物顺利通关，需向海关提交企业基本信息、营业执照等资料。

另外，还需办理电子口岸入网手续，用于企业口岸业务的操作。

同时，外汇管理局备案也必不可少，这样才能合法收付外汇。

此外，有些产品可能涉及特殊监管，如进出口许可证等，需按产品要求办理。

别忘了还要办理检验检疫备案，要是出口的产品属于法定检验检疫范围，就必须有这个备案，不然货物没法顺利出口。

办理海关注册登记证书也很关键，这能让出口代理公司以自己名义办理报关业务，提高报关效率。

自理报检单位备案登记手续也得办，这样在需要报检时就能自行处理，方便很多。

对于出口退税相关，要到税务部门办理出口退税认定手续，以便合规办理退税业务。

还得申请原产地证书注册登记，要是出口产品想享受进口国关税优惠，这个就很重要。

一般还得有银行开户，用于外汇结算等资金往来操作。

国际货运代理企业备案也可能需要，要是涉及货运代理服务的话。

部分特殊行业产品出口，可能要办行业特定的资质许可，像食品出口可能要食品相关资质。