这是一个需要根据您具体情况权衡利弊的问题，以下是一些可以考虑的因素。

如果您直接以工厂名义申请独立出口权，则可以使得您的品牌和产品更直接地展现在海外市场上，有利于提高知名度和建立信任。此外，此种方式可以降低贸易成本、节省时间和精力，并且减少了一些贸易环节中的风险（如货品被非法转卖等问题）。

然而，直接申请独立出口权也存在一定的缺点。首先，这种方式要求您必须拥有稳定和可靠的贸易渠道和客户资源。其次，如果您将来打算扩展业务，可能需要额外投入人力、物力和财力来支持您的出口业务。

相比之下，单独成立一个贸易公司可以为您提供更加灵活的发展空间。例如，您可以根据市场变化更快地调整您的采购和销售策略，同时也可以避免与工厂直接挂钩带来的风险。此外，通过成立一个新的公司，您可以更好地分离出口部门的财务和业务管理，减少出口业务对工厂核心业务的干扰。

当然，单独成立一个贸易公司也存在一些不足。首先，建立并运营一家公司需要更多的资金和资源，包括注册费、税务和法律咨询等成本。其次，新公司需要从头开始建立客户资源、品牌信誉，运营起来可能需要更多的时间和精力。

因此，您需要根据自身情况和业务需求，做出一份对比权衡，决定哪种方式最适合您的外贸业务。