垫付退税出口代理常见收费方式主要有以下两种。

其一，按出口金额的一定比例收费，一般比例在0.8%-3%左右，具体比例会因货物类型、贸易复杂程度等因素有所不同。例如，常见的普通产品，比例可能在1%-1.5%；若是高货值或复杂的电子产品等，比例可能偏低，在0.8%-1%。

其二，按单票收费，每票收费在800 - 3000元不等，这种收费方式对于货值较低但票数多的业务较为合适。同时，可能还会有一些其他的杂费，如报关费、文件费等。选择时要综合考量自身业务情况，与代理公司沟通清楚各项费用，避免后期产生纠纷。

有些代理会根据退税金额来收费，不过这种方式相对较少。一般会在退税金额的10%-20%左右，具体也得看代理公司的规定和业务情况。

除了常见收费，要注意有些代理会在操作过程中，以各种名义收取额外费用。所以合作前一定要让代理明确列出所有可能产生的费用项目。

收费还和代理公司提供的服务范围有关。如果服务全面，像帮忙做单证、处理物流等，收费可能会相对高一些。

市场上收费差异较大，建议多找几家代理公司咨询对比，了解他们收费标准背后所包含的具体服务内容，再做决定。

如果长期有出口业务，和代理协商时，争取更优惠的收费方案，比如按年度业务量来定一个综合收费标准。

部分代理可能会根据客户的信用情况调整收费，信用好的客户或许能拿到更优惠的价格。

收费还受地域因素影响，沿海外贸发达地区竞争激烈，收费相对低些；内陆地区可能会稍高。

可以参考同行合作的代理公司收费情况，这样能对市场行情有更准确的把握。