代理进口是可以进行抵扣的，但需要满足一定条件。首先，你公司需是一般纳税人，取得合法有效的海关进口增值税专用缴款书，且该缴款书上标明的缴款单位是你公司或你公司与代理方共同作为缴款单位。

其次，进口货物需用于增值税应税项目，如果用于免税项目、集体福利等则不能抵扣。

关于流程，取得海关进口增值税专用缴款书后，需登录增值税发票综合服务平台进行勾选确认，然后按照规定在纳税申报时填写相应栏次进行抵扣。需注意核对缴款书上信息是否准确，保存好相关进口合同、报关单等资料，以备税务机关核查。

要注意代理进口协议得明确双方权利义务，尤其是涉及税务处理部分，不然可能影响抵扣。如果海关缴款书信息有误，要及时联系相关部门更正。

抵扣期限也要留意，现在没有认证确认、稽核比对、申报抵扣的期限限制了，但还是尽早处理为好，以免遗忘。并且要保证进口业务真实，不然属于违规抵扣。

海关进口增值税专用缴款书的格式、内容等要合规。要是缴款书不符合规定，也没办法进行抵扣。进口货物的用途一定要符合抵扣要求。

在抵扣时，别忘了进口环节缴纳的关税不能抵扣，只有进口增值税符合条件才可抵扣?；褂幸繁４矸接泻戏ê瞎娴拇斫谧手?。

如果是双抬头的海关进口增值税专用缴款书，你公司和代理方只能有一方抵扣，不能重复抵扣，不然被查出来就麻烦了。

保存好与代理进口相关的整套资料，除了合同、报关单，像运输单据等也得留好，这些可能在税务核查时用得上。

注意进口货物的归类，因为不同归类可能对应不同税率，影响增值税计算和抵扣金额。要是归类有误，后续可能面临调整。

财务人员要准确核算进口货物成本及相关税费，正确进行账务处理，这对顺利抵扣及财务核算准确性都很重要。