出口代理退税的收费方式并没有统一标准，常见的有按笔收费、按金额比例收费。按笔收费时，若业务简单，每笔可能在2000 - 5000元不等；若业务复杂，收费会更高。按金额比例收费的话，一般是按照出口货物的报关金额的一定比例收取，比例范围大概在0.5% - 2%。比如出口货物报关金额为100万元，若按1%比例收费，代理费就是1万元。

此外，有些代理公司可能会收取一些其他费用，比如文件处理费、快递费等，但正规的如中贸达，这些费用都会提前和客户说明，不存在隐藏收费。在选择出口代理时，要多对比不同公司的收费模式及标准，综合考量其服务质量、口碑等，确保自身利益不受损。

收费还得看出口产品的类别，要是产品退税政策复杂，收费相对就高。像一些特殊监管的产品，代理公司要花费更多精力研究政策，收费可能会比普通产品高一些。

规模大的代理公司收费可能稍高，但服务更规范。规模小的代理公司可能为吸引客户收费低，不过服务质量和稳定性可能没那么有保障，所以不能光看价格。

地区差异也会影响收费。一线城市经济发达，人力成本高，代理退税收费普遍比二三线城市高一些。

如果退税涉及到单证整理、数据申报等多项复杂工作，收费也会相应增加，毕竟代理公司投入的工作量变大了。

长期合作的话，部分代理公司可能会给予一定优惠，能降低总体的代理退税费用。

代理退税收费还跟退税率高低有关，退税率高的产品，代理公司承担风险相对大些，收费可能会调整。

要是企业自身提供的资料完整、准确，能让代理工作顺利进行，也许代理公司在收费上会有小幅度优惠。

市场竞争也会影响收费，在竞争激烈地区，代理公司为揽客可能会适当降低收费标准。