进口报关代理费一般根据其用途和性质来确定计入的科目。如果是为了采购货物发生的进口报关代理费，通常应计入采购成本。因为这部分费用是使货物达到可使用或可销售状态的必要支出，会增加货物的入账价值。比如进口一批原材料，进口报关代理费就应和原材料的价款、运输费等一并计入原材料成本。

若进口的货物是用于销售，且报关代理费金额较小，对成本影响不大，也可计入销售费用，因为这与销售活动有一定关联。

要是该费用与企业日常经营管理相关，并非直接与采购或销售挂钩，如为了办理一些进口手续的综合代理费用，可计入管理费用。

如果是贸易公司，进口报关代理费多数情况计入销售费用，毕竟主要是为销售进口货物服务的。

对于生产型企业，若进口材料用于生产，报关代理费计采购成本更合适，这样成本核算更准确。

当报关代理费是为特定项目进口设备发生的，可计入该项目成本，便于项目成本核算。

要是费用金额极小，从简化核算角度，计入管理费用也可以。

如果是进口样品产生的报关代理费，可计入销售费用中的样品费明细科目。

当进口货物自用，如进口办公设备，报关代理费可考虑计入固定资产成本。

如果是因进口环节的特殊手续办理产生的代理费，与一般采购销售关系不大，计入管理费用较合适。

如果企业有专门的进出口业务部门，报关代理费可先归集到该部门的费用，再按一定方法分摊。