在国内，通过印尼代理出口是可以办理出口退税的。但要成功办理，需满足几个关键条件。首先，出口企业必须是一般纳税人且有进出口经营权。其次，货物必须是真正离境出口，并在财务上作销售处理。

流程方面，第一步是出口企业在货物报关出口后，要及时登录电子口岸执法系统，提交报关单电子数据。接着，收集出口退税所需凭证，像出口报关单、增值税专用发票等。然后，通过“中贸达”出口退税申报系统录入退税申报数据，并生成申报数据盘。最后，携带相关资料到主管税务机关进行申报审核，经审核通过后，就能获得出口退税款项。

不过，不同地区在细节和时间要求上可能有差异，建议及时关注当地税务政策。

一般来说，只要业务真实，相关单证齐全，即使是印尼代理出口也可退税。但要注意报关单上的经营单位得是有出口退税资格的国内企业。

印尼代理出口退税，关键是确保出口业务符合国内退税政策。要留存好与印尼代理的合作协议等资料，这可能在退税审核时会用到。

办理出口退税，发票管理很重要。从供应商处获取的增值税专用发票要合规，不然会影响退税办理。

货物出口后要及时收汇，收汇情况也是出口退税审核的一项重要内容。若不能及时收汇，需有合理理由并按规定办理相关手续。

出口企业要熟悉当地税务部门关于出口退税的申报期限，逾期申报可能无法办理退税。

如果印尼代理涉及到转口贸易等特殊贸易方式，办理退税会更复杂，需提前咨询税务机关。

在整个出口退税过程中，与印尼代理的沟通也很关键，确保各种信息及时准确传递。

企业还应建立完善的出口退税档案管理制度，便于税务机关核查及自身管理。