外贸代理出口退税遇到困难，可以从以下几方面着手解决。首先，资料审核不通过，要仔细核对资料，确保报关单、发票等各类单证真实、准确且齐全，与实际业务相符，同时按要求规范填写。对于政策理解模糊，应及时关注国家税务总局等官方渠道发布的政策解读，也可参加税务部门组织的培训或咨询专业税务顾问，准确把握政策要点。退税进度缓慢，可与外贸代理及税务部门沟通，了解具体原因。若是资料问题及时补充，若是流程问题则跟进催办。日常做好出口业务资料的整理和留存，建立完善的出口退税业务台账，以便随时自查和应对检查，这样能有效提高出口退税的效率，减少困难。

可以梳理下过往退税流程，看看是哪类资料常出问题，之后针对性改进。跟外贸代理多沟通，让他们提供更详细的资料准备清单。

和税务专管员保持联系，遇到政策疑问及时请教。另外，在与外贸代理签订合同时，明确退税相关责任和义务，避免后期推诿。

利用一些专业的财税软件辅助管理出口退税业务，这样能更高效准确地处理数据，减少人为错误，提高退税申报成功率。

定期总结出口退税遇到的问题，形成经验教训文档，方便公司内部学习，下次遇到类似情况就能更好应对。

提前规划好退税时间，预留足够时间处理可能出现的问题，避免因时间紧张导致出错。

加强与供应商沟通，确保取得的发票等资料符合退税要求，避免因上游问题影响退税。

如果公司有条件，可以安排专人负责出口退税业务，深入学习研究相关政策和流程，提高专业性。

多参考同行业其他公司出口退税的经验，加入相关行业交流群，互相学习借鉴，少走弯路。