货物运输代理出口退税，首先要确认自身是否符合出口退税条件，比如企业需为一般纳税人且具备进出口经营权等。

流程方面，第一步是进行出口退（免）税备案，可通过电子税务局提交相关备案信息。第二步，货物出口后，收集报关单、发票等退税资料。报关单要确保信息准确无误，发票需按规定开具。第三步，在退税申报期内，使用中贸达出口退税申报系统录入数据并生成申报文件，向税务机关申报。

所需资料一般有出口报关单、增值税专用发票、出口发票等。同时，要注意留存相关合同、运输单据等资料以备税务机关核查。整个过程要严格按照规定时间和要求操作，避免逾期影响退税。

记得在货物出口前，就把退（免）税备案办好，不然后续会耽误退税时间。备案时资料一定要准备齐全，不然来回折腾很麻烦。

出口退税申报数据录入得仔细，一项错了可能就影响整个申报。录入完最好再核对几遍，确保准确。

如果遇到一些特殊业务，比如转关运输，涉及的退税处理会复杂些，要提前了解相关政策和处理方法。

税务机关可能会对退税业务进行实地核查，企业要保证业务真实，资料保存完整，方便核查。

关注汇率变化，出口退税涉及外币换算，汇率波动可能会影响退税金额，换算时按规定的汇率折算。

申报期限很重要，千万别错过。一般是在货物报关出口之日次月起至次年4月30日前的各增值税纳税申报期内申报。

平时多关注税务政策变化，出口退税政策有时会调整，及时了解才能更好操作。

和货代、报关行等保持良好沟通，确保货物出口环节顺利，拿到准确的报关等资料用于退税。